L'elemento caratterizzante il Parco Botanico di Stigliano è senza dubbio l'acqua.
All'interno di esso sgorgano numerosi sorgenti, e vi scorrono due piccoli fiumi: il Fosso delle Sette Cannelle e La Lenta che si vanno a ricongiungere per poi confluire, più a valle, nel fiume Mignone.
Questi due corsi d'acqua creano nel loro percorso degli angoli suggestivi, favorendo, inoltre, lo sviluppo della vegetazione sia quella spontanea che quella accuratamente predisposta dalla curatrice del parco.